Logiciel pClamp 11

Caractéristiques du logiciel pClamp 11: 

Points clés du logiciel pClamp 11: 

• P​​​rogrammes expérimentaux avancés associés à un puissant éditeur de protocoles

• Analyse des données avec davantage de précision grâce aux traitements optimisés (Population Spike Analyses et Action Potential Analyses)

• Détection automatique d’évènements et nouveau système d’analyse des macro-données

Autres caractéristiques du logiciel pClamp 11: 

La suite logicielle Axon™ pCLAMP™ de Molecular Devices est le programme le plus largement utilisé par la communauté des électrophysiologistes.

Ce programme est conçu pour l’acquisition et l'analyse de données provenant d'expérimentations en technique de potentiel imposé, de courant imposé (en patch-clamp/intracellulaire).

La suite logicielle pCLAMP 11 comprend le logiciel Clampex 11 pour l'acquisition des données, le logiciel AxoScope 11 pour la visualisation des données en temps réel, le logiciel Clampfit 11 pour l'analyse des données et désormais, le nouveau module d'analyse avancé Clampfit (en option) pour une analyse plus sophistiquée et rationnelle.

La version pClamp 11 est la version de pClamp très nettement améliorée avec un éditeur de protocoles plus flexible, un nombre plus important d’épisodes de protocoles et des durées de stimulations augmentées. Désormais, le logiciel permet de voir plusieurs canaux simultanément.

Les protocoles complexes de stimulations peuvent être configurés à partir de plusieurs sources telles Protocol Editor de Clampex 11 Software, pCLAMP Software ABF data files, et ASCII text files.

Des protocoles standard permettent la création de créneaux, rampes, fonctions cosinus, trains d'impulsions (bi-phasiques), profils sinusoïdaux ou triangulaires…

Analyse des données 

Le programme Clampex 11 permet l’analyse des données en temps réel selon des critères tels que la mesure de l’amplitude au pic des évènements, les calculs d’aires, les moyennes des évènements et le calcul de la déviation standard.

Ce programme inclus une palette complète d'outils d'analyse et de représentations graphiques de données électrophysiologiques.

Pour l'ajustement de courbes, les expérimentateurs ont le choix parmi 37 fonctions prédéfinies ou concevoir leurs propres analyses.

De plus sont inclus des outils d'analyse spécialisés comprenant des transformations rapides de Fourier, l'analyse de la variance-moyenne, l'analyse péri-évènement, l'analyse des bouffées, etc.

Une gamme de possibilités graphiques est disponible dans la fenêtre graphique pour

un affichage efficace des résultats et des données. Les analyses standard d'auto-corrélation et de corrélation croisée permettent la comparaison des données et donnent des tendances au sein d’une ou entre des populations. Pour les études de modulation synaptique, l'analyse V-M dans le logiciel Clampfit 11 constitue une méthode solide pour l'identification et la caractérisation des sites pré / post-synaptiques.

Détection d'évènements

Ce logiciel est un outil particulièrement flexible et efficace pour la détection d’évènements  de faible amplitude tels que potentiels post-synaptiques excitateurs (EPSPs) et inhibiteurs (IPSPs) ; ces évènements rapides ayant des amplitudes variables, ils sont donc détectés par une fonction algorithmique complexe analysant leur décours (pente) d’activation.

L'analyse en mode canal unique du logiciel Clampfit 11 permet le traitement complet de 10⁶ évènements à partir de données continues ou épisodiques. Les états ouverts, fermés et de conductance des canaux ioniques dans les membranes naturelles ou artificielles sont détectés et mesurés. Jusqu'à huit niveaux d'états ouverts sont pris en charge.

La détection et la mesure de l’amplitude des potentiels d'action ont été considérablement améliorées et attribuées à une option de détection distincte. Elle permet la mesure sélective de toutes les propriétés du potentiel d'action telles que les temps de montée et de descente, les potentiels de seuil, la durée et l'amplitude des post-potentiels, etc.